Fenotipificación y genotipificación en pacientes con enfermedad inflamatoria intestinal en un centro de referencia de Colombia
DOI:
https://doi.org/10.47892/rgp.2024.441.1609Palabras clave:
Enfermedades inflamatorias del intestino, Fenotipo, Genotipo, Genética, Colitis ulcerosa, Enfermedad de CrohnResumen
Introducción: Se ha tratado de identificar los factores genéticos relacionados con susceptibilidad para enfermedad inflamatoria intestinal (EII), y los hallazgos actuales se inclinan por un modelo de patología complejo, sin un patrón hereditario claro. Objetivo: Realizar caracterización fenotípica y genotípica de pacientes con EII en población colombiana y describir su posible asociación con predisposición. Materiales y métodos: Serie de casos, 16 pacientes con EII por criterios clínicos y anatomopatológicos, inicio de síntomas gastrointestinales después de los 18 años. Todos tuvieron asesoramiento genético pre-test y se realizaron árboles genealógicos de mínimo tres generaciones. También, genotipificación, por medio de un panel de genes múltiples que incluía genes relacionados con EII y algunos trastornos autoinmunitarios. Finalmente, se realizó análisis genómico de variantes. Resultados: 9 mujeres y 7 hombres, con edad media de diagnóstico de EII 35 años, y 32 años para aparición de síntomas gastrointestinales. 11/16(68,75%) requirieron terapia biológica. 10/16 (62,5%) presentaron refractariedad a terapia estándar. 3/16 (18,75%) tenían antecedentes familiares positivos de EII. 100% casos presentaron al menos un single nucleotide polymorphism relacionado con riesgo de EII en más de un gen. Los genes más relacionados con colitis ulcerosa (CU), fueron CD48, CD6, y TYK2 para CU, y CD6 e ITGAM para la enfermedad de Crohn. El gen más frecuente fue CD6. Se observó en 3/16 (18,75%) presencia de hasta 5 genes, 4 en 3/16 (18,75%), y tres en 5/16 (31,25%). Conclusión: En EII hay presencia de variantes genéticas con predisposición asociada, pero sin patogenicidad confirmada, y cuya sumatoria parece contribuir en su fisiopatología
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Lamb CA, Kennedy NA, Raine T, Hendy PA, Smith PJ, Limdi JK, et al. British Society of Gastroenterology consensus guidelines on the management of inflammatory bowel disease in adults. Gut. 2019;68(Cdc):s1-106. doi: 10.1136/gutjnl-2019-318484.
Bernstein CN, Wajda A, Svenson LW, MacKenzie A, Koehoorn M, Jackson M, et al. The epidemiology of inflammatory bowel disease in Canada: A population-based study. Am J Gastroenterol. 2006;101(7):1559-68. doi: 10.1111/j.1572-0241.2006.00603.x.
Rubin DT, Ananthakrishnan AN, Siegel CA, Sauer BG, Long MD. ACG Clinical Guideline: Ulcerative Colitis in Adults. Am J Gastroenterol. 2019;114(3):384-413. doi: 10.14309/ajg.0000000000000152.
Kappelman MD, Rifas-Shiman SL, Kleinman K, Ollendorf D, Bousvaros A, Grand RJ, et al. The Prevalence and Geographic Distribution of Crohn’s Disease and Ulcerative Colitis in the United States. Clin Gastroenterol Hepatol. 2007;5(12):1424-9. doi: 10.1016/j.cgh.2007.07.012.
Chan SSM, Luben R, Olsen A, Tjonneland A, Kaaks R, Teucher B, et al. Body mass index and the risk for crohn’s disease and ulcerative colitis: Data from a european prospective cohort study (The IBD in EPIC Study). Am J Gastroenterol. 2013;108(4):575-82. doi: 10.1038/ajg.2012.453.
Juliao F, Damas OM, Arrubla M, Calixto OJ, Camargo JL, Cruz L, et al. Sa1798 – The Prevalence of Inflammatory Bowel Disease in Colombia is Increasing: Report on the National Prevalence of IBD and Description of IBD Phenotype. Gastroenterology. 2019;156(6):S-405. doi: 10.1016/S0016-5085(19)37865-5.
Fernández-Ávila DG, Bernal-Macías S, Parra-Izquierdo V, Rincón-Riaño DN, Gutiérrez JM, Rosselli D. Prevalencia en Colombia de la enfermedad inflamatoria intestinal y el compromiso articular asociado, según información del Sistema Integral de Información de la Protección Social. Rev Colomb Reumatol. 2020;27(1):3-8.
Younis N, Zarif R, Mahfouz R. Inflammatory bowel disease: between genetics and microbiota. Mol Biol Rep. 2020;47(4):3053-63. doi: 10.1007/s11033-020-05318-5.
Jostins L, Ripke S, Weersma RK, Duerr RH, McGovern DP, Hui KY, et al. Host-microbe interactions have shaped the genetic architecture of inflammatory bowel disease. Nature. 2012;491(7422):119-24. doi: 10.1038/nature11582.
Liu JZ, Van Sommeren S, Huang H, Ng SC, Alberts R, Takahashi A, et al. Association analyses identify 38 susceptibility loci for inflammatory bowel disease and highlight shared genetic risk across populations. Nat Genet. 2015;47(9):979-86. doi: 10.1038/ng.3359.
McGovern DPB, Kugathasan S, Cho JH. Genetics of Inflammatory Bowel Diseases. Gastroenterology. 2015;149(5):1163-1176.e2. doi: 10.1053/j.gastro.2015.08.001.
Loddo I, Romano C. Inflammatory bowel disease: Genetics, epigenetics, and pathogenesis. Front Immunol. 2015;6:551. doi: 10.3389/fimmu.2015.00551.
Liu TC, Stappenbeck TS. Genetics and Pathogenesis of Inflammatory Bowel Disease. Annu Rev Pathol Mech Dis. 2016;11(Cdc):127-48. doi: 10.1146/annurevpathol-012615-044152.
Nunes T, Fiorino G, Danese S, Sans M. Familial aggregation in inflammatory bowel disease: Is it genes or environment? World J Gastroenterol. 2011;17(22):2715-22. doi: 10.3748/wjg.v17.i22.2715.
Ferrari M, Stagi S. Autoimmunity and genetic syndromes: A focus on down syndrome. Genes (Basel). 2021;12(2):268. doi: 10.3390/genes12020268.
Cho JH, Brant SR. Recent insights into the genetics of inflammatory bowel disease. Gastroenterology. 2011;140(6):1704-12. doi: 10.1053/j.gastro.2011.02.046.
Ventham NT, Kennedy NA, Nimmo ER, Satsangi J. Beyond gene discovery in inflammatory bowel disease: The emerging role of epigenetics. Gastroenterology. 2013;145(2):293-308. doi: 10.1053/j.gastro.2013.05.050.
Dupont A, Heinbockel L, Brandenburg K, Hornef MW. Antimicrobial peptides and the enteric mucus layer act in concert to protect the intestinal mucosa. Gut Microbes. 2015;5(6):761-5. doi: 10.4161/19490976.2014.972238.
Pelaseyed T, Bergström JH, Gustafsson JK, Ermund A, Birchenough GMH, Schütte A, et al. The mucus and mucins of the goblet cells and enterocytes provide the first defense line of the gastrointestinal tract and interact with the immune system. Immunol Rev. 2014;260(1):8-20. doi: 10.1111/imr.12182.
Hugot JP, Chamaillard M, Zouali H, Lesage S, Cézard JP, Belaiche J, et al. Association of NOD2 leucine-rich repeat variants with susceptibility to Crohn’s disease. Nature. 2001;411(6837):599-603. doi: 10.1038/35079107.
Horowitz JE, Warner N, Staples J, Crowley E, Gosalia N, Murchie R, et al. Mutation spectrum of NOD2 reveals recessive inheritance as a main driver of Early Onset Crohn’s Disease. Sci Rep. 2021;11(1):5595. doi: 10.1038/s41598-021-84938-8.
Liu Z, Zhang Y, Jin T, Yi C, Ocansey DKW, Mao F. The role of NOD2 in intestinal immune response and microbiota modulation: A therapeutic target in inflammatory bowel disease. Int Immunopharmacol. 2022;113(Pt B):109466. doi: 10.1016/j.intimp.2022.109466.
Cao Y, Qu C, Chen Y, Li L, Wang X. Association of ABCB1 polymorphisms and ulcerative colitis susceptibility. Int J Clin Exp Pathol. 2015;8(1):943-7.
Borg-Bartolo SP, Boyapati RK, Satsangi J. Precision medicine in inflammatory bowel disease: Concept, progress and challenges. F1000Res. 2020;9:F1000 Faculty Rev-54. doi: 10.12688/f1000research.20928.1.
Mesbah-Uddin M, Elango R, Banaganapalli B, Shaik NA, Al-Abbasi FA. In-silico analysis of inflammatory bowel disease (IBD) GWAS loci to novel connections. PLoS One. 2015;10(3):e0119420. doi: 10.1371/journal.pone.0119420.
Chen GB, Lee SH, Brion MJA, Montgomery GW, Wray NR, Radford-Smith GL, et al. Estimation and partitioning of (co) heritability of inflammatory bowel disease from GWAS and immunochip data. Hum Mol Genet. 2014;23(17):4710-20. doi: 10.1093/hmg/ddu174.
Rivas MA, Beaudoin M, Gardet A, Stevens C, Sharma Y, Zhang CK, et al. Deep resequencing of GWAS loci identifies independent rare variants associated with inflammatory bowel disease. Nat Genet. 2011;43(11):1066-73. doi: 10.1038/ng.952.
Uhlig HH, Charbit-Henrion F, Kotlarz D, Shouval DS, Schwerd T, Strisciuglio C, et al. Clinical Genomics for the Diagnosis of Monogenic Forms of Inflammatory Bowel Disease: A Position Paper From the Paediatric IBD Porto Group of European Society of Paediatric Gastroenterology, Hepatology and Nutrition. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2021;72(3):456-73. doi: 10.1097/MPG.0000000000003017.
Loh JT, Lee KG, Lee AP, Teo JKH, Lim HL, Kim SSY, et al. DOK3 maintains intestinal homeostasis by suppressing JAK2/STAT3 signaling and S100a8/9 production in neutrophils. Cell Death Dis. 2021;12(11):1054. doi: 10.1038/s41419-021-04357-5.
Peters LA, Perrigoue J, Mortha A, Iuga A, Song WM, Neiman EM, et al. A functional genomics predictive network model identifies regulators of inflammatory bowel disease. Nat Genet. 2017;49(10):1437-49. doi: 10.1038/ng.3947.
Edwards RA, Witherspoon M, Wang K, Afrasiabi K, Pham T, Birnbaumer L, et al. Epigenetic repression of DNA mismatch repair by inflammation and hypoxia in inflammatory bowel diseaseassociated colorectal cancer. Cancer Res. 2009;69(16):6423-9. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-09-1285.
Anderson CA, Boucher G, Lees CW, Franke A, D’Amato M, Taylor KD, et al. Meta-analysis identifies 29 additional ulcerative colitis risk loci, increasing the number of confirmed associations to 47. Nat Genet. 2011;43(3):246-52. doi: 10.1038/ng.764.
Till A, Lipinski S, Ellinghaus D, Mayr G, Subramani S, Rosenstiel P, et al. Autophagy receptor CALCOCO2/NDP52 takes center stage in Crohn disease. Autophagy. 2013;9(8):1256-7. doi: 10.4161/auto.25483.
Shen M, Moran R, Tomecki KJ, Yao Q. Granulomatous disease associated with NOD2 sequence variants and familial camptodactyly: An intermediate form of NOD2-associated diseases? Semin Arthritis Rheum. 2015;45(3):357-60. doi: 10.1016/j.semarthrit.2015.05.007.
Yao Q, Piliang M, Nicolacakis K, Arrossi A. Granulomatous pneumonitis associated with adult-onset Blau-like syndrome. Am J Respir Crit Care Med. 2012;186(5):465-6. doi: 10.1164/ajrccm.186.5.465.
Burillo-Sanz S, Montes-Cano MA, García-Lozano JR, OrtizFernández L, Ortego-Centeno N, García-Hernández FJ, et al. Mutational profile of rare variants in inflammasome-related genes in Behçet disease: A Next Generation Sequencing approach. Sci Rep. 2017;7(1):8453. doi: 10.1038/s41598-017-09164-7.
Lesage S, Zouali H, Cézard JP, Colombel JF, Belaiche J, Almer S, et al. CARD15/NOD2 mutational analysis and genotypephenotype correlation in 612 patients with inflammatory bowel disease. Am J Hum Genet. 2002;70(4):845-57. doi: 10.1086/339432.
Lin Z, Wang Z, Hegarty JP, Lin TR, Wang Y, Deiling S, et al. Genetic association and epistatic interaction of the interleukin-10 signaling pathway in pediatric inflammatory bowel disease. World J Gastroenterol. 2017;23(27):4897-909. doi: 10.3748/wjg.v23.i27.4897.
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